Bảo tàng Ai Cập lưu giữ nhiều mảnh ghép quan trọng của lịch sử Ai Cập cổ đại. Nơi đây lưu giữ bộ sưu tập cổ vật từ thời đại các pharaon lớn nhất thế giới. Chính phủ Ai Cập đã cho thành lập bảo tàng và xây dựng vào năm 1835 gần vườn Ezbekeyah, sau đó chuyển đến thủ đô Cairo. Năm 1855, Maximiliano I của México đã được chính phủ Ai Cập trao tặng tất cả các cổ vật; những vật này hiện đang ở trong Bảo tàng Kunsthistorisches ở Vienna.

Một tòa nhà bảo tàng mới được thành lập tại Boulaq vào năm 1858 từ một nhà kho cũ, lưu giữ bộ cổ vật mới dưới sự chỉ đạo của Auguste Mariette. Tòa nhà nằm trên bờ sông Nile, vào năm 1878, nó đã chịu thiệt hại đáng kể trong một trận lụt lớn của sông Nile. Năm 1891, bộ sưu tập đã được chuyển đến một cung điện hoàng gia cũ, ở quận Giza của Cairo.[2] Chúng được bảo quản ở đó cho đến năm 1902 khi chúng được chuyển đi lần cuối cùng đến bảo tàng hiện nay ở Quảng trường Tahrir, được xây dựng bởi công ty Giuseppe Garozzo và Francesco Zaffrani của Ý và thiết kế bởi kiến ​​trúc sư người Pháp Marcel Dourgnon.[3]

Năm 2004, bảo tàng đã bổ nhiệm Wafaa El Saddik làm nữ tổng giám đốc đầu tiên.[4] Trong cuộc Cách mạng Ai Cập 2011, bảo tàng đã bị phá hủy một phần và hai xác ướp bị hư hại nghiêm trọng.[5][6] Một số cổ vật được trưng bày cũng được cho là đã bị hư hại.[7] Khoảng 50 hiện vật đã bị mất.[8] Sau đó, 25 trong số 50 hiện vật đã được tìm thấy. Những tác phẩm đã được khôi phục đã được đưa vào trưng bày trong bảo tàng từ tháng 9 năm 2013 trong một cuộc triển lãm mang tên Thiệt hại và Phục hồi (Damaged and Restored). Trong số các hiện vật được trưng bày, có hai bức tượng của pharaon Tutankhamun làm bằng gỗ tuyết tùng và lớp phủ vàng, một bức tượng của vua Akhenaten, bức tượng ushabti của về các vị vua Nubian, xác ướp của một đứa trẻ và một chiếc bình thủy tinh nhỏ.[9]